Zgodnie z Instrukcją kancelaryjną UJ, wskazano symbole klasyfikacyjne akt, które stanowią wyjątki od stosowania tradycyjnego dokumentowania przebiegu załatwiania i rozstrzygania spraw.

Sprawy należy prowadzić w formie elektronicznej dla poniżej wskazanych klas JRWA:

• 270 Zasady przeprowadzania zamówień publicznych;
• 271 Rejestr zamówień publicznych;
• 272 Postępowanie w trybie zamówień publicznych;
• 4000 Założenia organizacyjno - programowe kierunków studiów pierwszego stopnia, drugiego stopnia oraz jednolitych studiów magisterskich;
• 4001 Uruchamianie i likwidacja kierunków studiów pierwszego stopnia, drugiego stopnia oraz jednolitych studiów magisterskich;
• 4004 Programy studiów dla kierunków studiów pierwszego stopnia, drugiego stopnia oraz jednolitych studiów magisterskich;
• 4090 Działalność studencka;
• 4091 Studencki ruch naukowy;
• 4092 Studencki organizacje kulturalne, artystyczne, sportowe;
• 420 Założenia organizacyjno-programowe studiów podyplomowych;
• 421 Uruchamianie i likwidacja studiów podyplomowych;
• 430 Założenia organizacyjno-programowe kształcenia ustawicznego;
• 065 Patronaty honorowe;
• 150 Czas pracy;
• 230 Ewidencja środków trwałych;
• 3110 Finansowanie Uczelni;
• 320 Rejestry księgowe;
• 321 Dowody księgowe;
• 322 Ewidencja syntetyczna i analityczna;
• 323 Rozliczenia;
• 360 Interwencje kwestora;
• 362 Inne sprawy nadzoru finansowego;
• 870 Podstawowe zasady dotyczące gromadzenia, opracowywania i udostępniania zasobu archiwalnego Uczelni;
• 871 Przyjmowanie dokumentacji do Archiwum Uczelni;
• 872 Ewidencja dokumentacji w Archiwum Uczelni;
• 8730 Rejestr udostępniania dokumentacji w Archiwum Uczelni;
• 8731 Udostępnianie dokumentacji dla osób z zewnątrz;
• 8732 Wewnątrzuczelniane udostępnianie dokumentacji;
• 8733 Uszkodzenia lub zniszczenia dokumentacji;
• 8734 Kwerendy naukowe;
• 8735 Kwerendy urzędowe;
• 874 Brakowanie dokumentacji niearchiwalnej;
• 875 Dary i zakupy materiałów archiwalnych;
• 876 Opracowywanie zasobu historycznego Uczelni;
• 877 Inwentaryzacja zasobu Archiwum Uczelni.